Nauka w Gimnazjum została wznowiona. Początkowo organizacją Gimnazjum zajął się dr Wiktor Steffen. Pod jego kierownictwem przystąpiono do gromadzenia pomocy naukowych i sprzętów szkolnych. Na początku marca 1945 roku dr Steffen opuścił Nowe Miasto Lubawskie. Od 12 marca funkcją dyrektora przejął mgr Ludwik Krajewski. Do Gimnazjum uczęszczało 209 uczniów w trzech oddziałach klas I i po jednym oddziale klasy II oraz III. W tym okresie utworzono Samorząd Szkolny, męską drużynę harcerską, Szkolne Koło PCK oraz Koło Polonistów. 17 marca 1947 roku powstał Gimnazjalny Klub Sportowy ”Zgoda”.
